子宮內膜異位症患者常會出現經痛、不孕、性交痛等症狀，需要及早接受治療。中醫師廖寶彩表示，治療上以活血化瘀為根本；主症為經痛、月經過多者，行經期要加強活血化瘀、止血止痛；不孕者除活血化瘀，還可以配合月經周期療法，然後再加強補腎，腎精是生殖發育的基礎，配合使用何首烏、菟絲子、淫羊藿等藥。

月經周期療法常分經後期、經間期、月經期論治，經後期治宜益氣養血兼化瘀消癥法，適合用赤白芍、當歸、熟地、川芎、淮山藥等藥材，經間期採用補腎疏肝兼化瘀消癥法，適合用乳香、莪朮、三棱、仙靈脾、鹿角片等藥材，月經期採用行氣止痛兼化瘀消癥法，適合用莪朮、蒲黃、三棱、乳香、沒藥等藥材，治療後即可緩解症狀。

廖寶彩醫師進一步強調，子宮內膜異位症剛開始的階段大多為實證，但病程往往纏綿不易治，尤其拖得愈久愈難治，而且久病之後也可能變成虛證，加上久用活血化瘀藥也有傷正的缺點，因此，治療時仍應注意扶正，可根據個別患者的病情，酌加使用黨參、黃耆等藥材以扶助正氣。

中醫療法只適用於輕、中度子宮內膜異位症，中醫辨證後都可以治療；但重度患者如卵巢巧克力囊腫大於五公分、骨盆腔粘連、異位結節等就無法治療，主要是因為中藥難以達到消散囊腫、粘連的目的，因此重度須採取西醫療法